高雄市政府等县市以“慰问灾民”为由邀请达赖喇嘛于31日来台，获得马英九政府批准，在两岸政界、舆论界引发极大争议。
·行程：达赖在8月30日抵台后，预计9月1日举行祈福救灾法会，2日在南部演讲，3日前往北部演讲，9月4日离台；
·邀请者：高雄市长陈菊和嘉义县长陈明文、屏东县副县长锺佳滨等一批绿营官员；
·邀请借口：台当局表示主要是“宗教和人道上的考虑”、“愿访台为灾民祈福”
·岛内反对声音：南部许多灾民是原住民，且大部份是信奉基督教；“民进党是在消费达赖喇嘛”；其目的在于“制造马当局难题”
·大陆应对：两岸原定举办的多项交流活动纷纷喊停。国台办主任王毅更是取消出席“台湾周”的行程。
达赖在高雄巨蛋举行祈福法会。场外甚不平静，10多位商工统一促进会的成员，在法会现场外面举起白布条抗议，抗议达赖是分裂中华民族的工具，要他“滚回印度去”……
达赖喇嘛抵达台湾刚刚要搭高铁南下，就被上百民众包围。民众高喊:“滚回去滚回去，台湾是中国的！” 一时间，白布条、黄广告牌，还有从来没看到过的党旗对达赖内外夹攻……
达赖在莲潭国际会馆演讲，大约50名劳动党成员，中午就聚集在莲潭国际会馆，下午1点半左右，警方两度举牌，要求群众解散，但劳动党不为所动，警方和民众爆发推挤，并且短暂肢体冲突。
台湾宗教界也出现反弹的声音。台湾妈祖联谊会会长、大甲镇澜宫副董事长郑铭坤表示，妈祖联谊会所属各宫庙，在“八八水灾”发生后，立即发动赈灾，达赖来台，是抹杀台湾宗教界的努力
达赖在高雄小巨蛋进行八八风灾万人祈福法会，肃穆的法会仪式上，达赖戴上鸭舌帽，讲笑话；座前法会藏桌在搬动时整个垮了，好不尴尬。 达赖又向工作人员表示，室内会场灯光太强……
达赖在高雄有一场演讲，由于现场只能容纳5百个人，饭店另外加开一个会场，让7百人透过视讯来听演讲，但因为音响设备搞乌龙，饭店花了15分钟还修不好，很多听众气到离席。
达赖今天前往高雄县甲仙乡小林村举行祈福法会，高规格维安，层层人墙戒护，灾民难以接近，但法会历时仅约10分钟。达赖走进小林村法会现场，所到之处，随扈贴身护着达赖，民众难以接近。
达赖31日到小林村为灾民举办法会，并在当地的餐馆用了午餐。令人咋舌的是，“慰问灾民”的达赖竟然尝到了10道精美大菜！午餐包括东坡蒟蒻、药膳汤、三杯杏鲍菇等十道素菜。
陈菊指出，达赖此行纯为宗教抚慰人心，没有任何政治活动安排。民进党发言人郑文灿也说，达赖已经接受邀请，如果马当局阻止达赖喇嘛来台为受伤的土地和人民祈福，就像“外交部”发文拒绝国际救援一样荒谬…
该消息一经公布，就引来不少舆论质疑。民众党“立委”邱毅就说，达赖来台将严重影响两岸关系，更会惹麻烦，他们是嫌台湾的灾难不够多吗？邀请的人真没有头脑，而“国安”系统竟不知这件事，当局实在太过疏忽了！…
邱毅说，达赖来台将会惹麻烦，他们是嫌台湾的灾难不够多吗？ “立委”黄义交也表示，现在是全力救灾的时候，一旦达赖真的来了，将会使得救灾惹了政治，实在不恰当，应该让救灾单纯一点…
美国彭博社也认为，民进党对达赖发出邀请可能会伤害台海关系。报道援引台北文化大学政治学家杨泰顺的话说:“这一邀请与‘勒索’没什么区别。”他说，达赖访台湾从来都不是一个“单纯的宗教事件”…
当时，达赖喇嘛一再标榜他对台湾的访问“是进行宗教访问，与政治无关”。但他又不打自招地说，是次访问台湾，是“要寻求‘中间道路’的观点”，“重要的是李登辉公开支持了我的‘中间道路’，所以我去台湾没有什么困难”。达赖喇嘛“假自治、真独立”的“中间道路”，的确与当时李登辉“假拥护统一，真台独”的用心一拍即合。
2009年3月，高思博出席“立法院”内政委员会时，回答民进党籍“立委”翁金珠与国民党籍“立委”张庆忠的质询表示，达赖喇嘛分别在1997年及2001年访问过台湾，但2002年拒绝台湾当局的邀请，表明当时达赖集团正与北京谈判，不方便来。媒体报导达赖喇嘛表示，从2002年达赖集团展开与北京商谈，使得他的台湾之行至今未成行。
据当年台湾媒体报道，2001年4月5日上午，达赖喇嘛一行进入“总统府” 后，陈水扁“特别前往回廊迎接，两位似乎相见恨晚，陈准备了台湾桧木雕刻成的欢喜佛赠送，而达赖也献上哈达”。两人就 “台湾和西藏问题交换了意见”。4月7日，达赖与陈水扁再度会面，两人进行了“密谈”。达赖表示，要派“更多的西藏人到台湾工作”。
2009年3月，对于达赖访台问题，台“蒙藏委员会委员长 ”高思博说，西藏问题是困难度很高的政治问题，经“国安”系统评估，目前达赖来访的时机不适宜，作为多年朋友，“应该能了解彼此难处”。他认为，达赖想要访台是高度敏感的事情，当局的判断是目前时机不宜，当局必须评估达赖到世界各国引起的各种不同反应，考量台湾整体的利益。
台北消息：台湾“陆委会”副主委刘德勋十八日表示，大陆海协会、民间团体、大陆台商及个人承诺的台湾水灾捐款，截至今天累计约新台币十一亿二千一百多万元，这些捐款将汇入“内政部”赈灾专户统筹运用。
第二批7名大陆活动板房技术人员24日11时40分左右搭机飞抵高雄，他们与先期来台的3名同仁会合，投入协助台湾施工人员组装大陆活动板房的工作。据了解，大陆援台共1000套活动板房将在8月底前全部运抵台湾灾区。
高金素梅，在北京饭店的新闻发布会上说，对于国台办给台湾少数民族的2000万元专项救助款，她表示，代表团回去就会成立“88风灾原住民特别专案”，这个专案将由律师、会计师和来自灾区的团队一起负责。
考虑到岛内需要大载量的直升机救灾，中共中央台办、国务院台办主任王毅18日再次释放善意，他表示，大陆方面拟援助台湾的米－26直升机是民用设施，不具备军方背景，只要台湾方面需要，大陆可以马上支援。